Муниципальное казенное общеобразовательное учреждение "Гимназия №1" г.о. Нальчик открылось в 1961 году с введением в эксплуатацию нового здания по ул. Головко, 89, а самыми старшими в школе стали ученики 8-х классов. Но уже с этого года было создано научное общество учащихся "Юный историк", впоследствии (в марте 1997 года) оно было преобразовано в НОУ "Юные друзья науки". Несколько позже был организован учебно-опытный пришкольный участок, разбит плодовый сад и цветник. Четыре года школа являлась участницей ВДНХ в Москве. Незабываемыми для учеников и учителей стали годы дружбы с экипажем теплохода "Нальчик" Волжского пароходства, сотрудничество с учеными КБГУ, АН СССР, преподавателями МГУ. В 1991 году возродили научное общество учащихся, дав ему новое название ГНОМ - гимназическое научное объединение молодежи.
С 1992-1993 учебного года педагогический коллектив принял участие во всероссийском эксперименте профессора Л.В. Тарасова "Экология и диалектика". Экспериментальная работа, апробация новых учебников и технологий, новаций в области содержания образования, изменения в структуре и организации образовательного процесса, методической и воспитательной работе - всё это способствовало получению школой статуса гимназии в 1994 году.
С 1993-1994 учебного года в гимназии началась работа по интеграции основного и дополнительного образования, профильному обучению на третьей ступени и другим инновационным преобразованиям, основанным на интегративно-гуманитарном подходе, то есть, проецировании знаний на личность обучающегося.
Плодотворным оказалось творческое сотрудничество учителей и педагогов дополнительного образования: театральной студии "Яблочко" присвоено звание "Народный детский самодеятельный театр". Успешым был дебют театральной франкофонной студии "Синяя птица", получившей на V международном фестивале юношеских театров на французском языке "Менестрель - 2006" первую премию - "Золотую маску" и покорившей зрителей Польши, Германии, Франции.
С 2001 года в гимназии используется и совершенствуется педагогическая технология "Дебаты" как эффективное средство обучения на уроках общегуманитарного и естественно-научного циклов.
Гимназия неоднократно становилась победителем конкурсов: "Школа года", "Школа века", приоритетного национального проекта "Образование".
С 2006 года учителя гимназии 8 раз становились победителями конкурса лучших учителей в рамках Приоритетного национального проекта "Образование". 15 учителей являются лауреатами муниципального этапа Всероссийского конкурса "Учитель года". Дважды наши педагоги становились победителями и лауреатами регионального этапа Всероссийского конкурса "Учитель года".
Постановлением главы Местной администрации № 1764 от 12 августа 2011 года "Об изменении типа муниципального общеобразовательного учреждения "Гимназия №1" городского округа Нальчик изменен тип муниципального общеобразовательного учреждения "Гимназия №1" г.о. Нальчик на муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение "Гимназия №1" г.о. Нальчик.
С 2012 года гимназия функционировала в статусе федеральной и региональной экспериментальной площадки в рамках модели "Общественно-активная школа" .
С 2008 по 2013 год гимназия являлась региональной базовой площадкой по апробации учебной литературы национально-рагиональной составляющей образования.
Коллектив гимназии работает над созданием современной школы, отвечающей требованиям федерального государственного образовательного стандарта нового поколения.
Постановлением и.о. Главы местной администрации городского округа Нальчик № 2037 от 12 декабря 2012 года "Об изменении типа муниципального бюджетного общеобразовательного учреждения "Гимназия №1" городского округа Нальчик" изменен тип образовательного учреждения на муниципальное казенное общеобразовательное учреждение "Гимназия №1" г.о. Нальчик
14 мая 2013 года в соответствии с проведенной процедурой аккредитации образовательного учреждения МКОУ "Гимназия №1" получило свидетельство о государственной аккредитации сроком до 14 мая 2025 года.
29 ноября 2013 года образовательное учреждение приняло участие во Всероссийском образовательном форуме "Школа будущего", который состоялся в Санкт-Петербурге. По решению независимого общественного совета конкурса "100 лучших школ России" гимназия признана лауреатом конкурса в номинации "Лучшая гимназия". Директор гимназии Ордокова Лидия Алиевна награждена Почетным знаком "Директор года - 2013".
В 2013 году МКОУ "Гимназия №1" включена в Национальный Реестр "Ведущие образовательные учреждения России".
В 2013 году независимым общественным советом конкурса “100 лучших школ России” г. Санкт-Петербурга МКОУ “Гимназия №1” г.о. Нальчик награждена дипломом лауреата “100 лучших школ” в номинации “Лучшая гимназия”.
В 2014 году гимназия стала лауреатом конкурса “Новаторство в образовании” в номинациях “Самый успешный проект- 2014” в области патриотического воспитания. Проект – “Формирование исторической памяти подрастающего поколения посредством возможностей школьного музея” и “Самый успешный проект в области разработки и внедрения методов развития интеллектуальных способностей детей”. Проект – “Формула успеха: одаренный ученик плюс талантливый наставник”.
В 2016 году гимназия – лауреат Всероссийского конкурса образовательных проектов и программ по духовно-нравственному воспитанию детей и молодёжи “ГРАЖДАНИН и ПАТРИОТ РОССИИ-2016”, проходившем в г. Санкт-Петербурге, лауреат-победитель Всероссийского фестиваля-выставки образовательных учреждений РФ.
В рамках договора №1 от 11 ноября 2016 года о сетевом взаимодействии в области образовательной и профориентационной деятельности с ФГБОУ ВО “Кабардино-Балкарский государственный университет им. Х.М. Бербекова” на базе гимназии с 2018 года функционирует медицинский класс.